Länspolismästaren i Stockholm, Thomas Brogård, blir brutalt mördad under Folk och Försvar-konferensen på Högfjällshotellet i Sälen. Han var en omtyckt chef och verkar inte ha haft en enda fiende i livet, så det är helt obegripligt varför någon har skurit halsen av honom. Efter sig lämnar Thomas Brogård en förkrossad fru, två vuxna barn och en mängd obesvarade frågor. Polisen Petter Stigert är nyinflyttad på Lidingö. Han har lämnat Malung och sina smärtsamma minnen bakom sig för att skapa en bättre tillvaro för sin autistiske son Abbe. Petter blir satt på mordfallet och börjar nysta i familjehemligheterna. För det verkar som att något legat och pyrt under ytan i den framgångsrika kärnfamiljen Brogård.
Djupt mörker är Annika Subotins debut. En mörk berättelse där det psykologiska och vardagliga vävs samman med en deckarintrig full av oväntade vändningar och underliggande mörker. Lidingö är navet för berättelsen och intar härmed en självklar plats på den svenska deckarkartan.
Djupt mörker är första delen i Annika Subotins serie Polisen på Lidingö.